Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALX3O95076 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALX3O95076 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALX3O95076 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms