Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEDO75530 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEDO75530 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EEDO75530 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEDO75530 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEDO75530 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEDO75530 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEDO75530 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEDO75530 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEDO75530 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms