Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms