Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEMFO60524 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEMFO60524 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMFO60524 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms