Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCMT2O60294 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms