Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms