Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIP1O00291 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIP1O00291 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIP1O00291 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms