Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM1B2RUZ4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms