Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms