Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM200CA6NKL6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms