Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBFOX3A6NFN3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBFOX3A6NFN3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms