Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms