Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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