Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF835-201ENST00000537055 3450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NFASC-223ENST00000513543 3974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KBTBD12-201ENST00000343941 4121 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN2-212ENST00000638378 4447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EFNB2-201ENST00000245323 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRG3-201ENST00000287143 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CMKLR1-201ENST00000312143 5283 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNT15-201ENST00000339732 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A6-201ENST00000360421 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LCN1P1-201ENST00000372031 505 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA77.1-201ENST00000408156 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012354.2-201ENST00000423051 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL139246.1-201ENST00000424657 455 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms