Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF185-211ENST00000535861 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM5D-210ENST00000541639 5579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRMO-207ENST00000611338 3635 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC7-204ENST00000415775 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 C17orf102-201ENST00000623254 3997 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYT11-201ENST00000368324 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF549-202ENST00000376233 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUBB1-201ENST00000217133 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX005214.3-201ENST00000615174 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353770.3-201ENST00000616253 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLN3-244ENST00000636147 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT80-201ENST00000313234 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASB15-205ENST00000451215 2956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVILP1-201ENST00000422642 2676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6C66P-203ENST00000641469 4627 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDAR-202ENST00000376651 4303 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4290HG-201ENST00000426593 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NWD1-201ENST00000379808 7254 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133367.1-201ENST00000568177 4063 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM1P35-201ENST00000501931 3188 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRINP1-201ENST00000265922 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC15-202ENST00000428839 3248 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC22A14-201ENST00000273173 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133325.3-201ENST00000622757 3674 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB39-201ENST00000300101 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ECE1-202ENST00000357071 3763 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTMR2-204ENST00000409459 3420 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATOX1-201ENST00000313115 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA71E-201ENST00000365032 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms