Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms