Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQ87 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQ87 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQ87 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQ87 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms