Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms