Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRBQ9Y5M8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms