Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms