Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms