Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms