Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA9Q9UGM1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA9Q9UGM1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms