Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms