Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms