Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A2Q9NTI2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms