Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOPORSQ9NS56 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms