Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms