Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms