Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1EQ9GZS1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1EQ9GZS1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms