Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG101Q9BSB4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms