Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms