Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TCF12Q99081 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCF12Q99081 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms