Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms