Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms