Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms