Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXO17Q96EF6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms