Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms