Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms