Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC50Q8IVM0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC50Q8IVM0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms