Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms