Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7IPQ6VMQ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7IPQ6VMQ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms