Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms