Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms