Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMPK2Q5EBM0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms