Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms