Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP13A4Q4VNC1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms