Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR1Q2NL82 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms