Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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