Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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